miRBase entry: cre-MIR914

Stem-loop cre-MIR914


Accession
MI0005707
Description
Chlamydomonas reinhardtii cre-MIR914 precursor miRNA


Sequence

21579 reads, 1350.0 reads per million, 50 experiments
gccggacguuacggcaugacgacucacggcgugacgcugaacuugugacgaucgccguuuuaauucgggggaccuauaggcauuuguuaacucauaaucguuuuaaaucgcuccggaucuauagcgagcugggugcgggcgaccaucgcgcucgAGCUGCAACUCGCCCGGGCACCugcaaagcucggcgagcaccaucguuaaauacuucguaccauucuaucucugcaccuaaacgugugcagcugaguccgcgcgcggccccucgcugcugaugccgggggcgccccccgcgccuguccccgccuccccuccacggauuccggcgcgcccggggguugguaaugggugcuaaugcguguggcagcacggcguacauuugccaguugcaucuggaaugcucagggcuggccugcucugcccuagccuggcccugcccuugcacagggcaccccugcugcagucacuugcugcggcuaagcacggcugcaacccguggggggcgcugccgauugacgcgaaugcaagagaucggaggcccggcacccauuaccaacccccgggcgcgccggaauccguggaggggaggcggggacaggcgcggggggcgcccccggcaucggcagcgaggggccgcgcgcggacucagcugcacgcguuuaggugcagagauagaaugguacgaaguauuuaacgauggugcucgccgagcuuugcaGGUGCCCGGGCGAGUUGCAGCUcgagcgcgauggucgcccgcacccagcucgcuauagauccggagcgauuuaaaacgauuaugaguuaacaaaugccuauaggucccccgaauuaaaacggcgaucgucacaaguucagcgucacgccgugagucgucaugccgugacguccggc
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Structure
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                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cccggaggcuagagaacguaagcgcaguuagccgucgcggggggugcccaacgucggcacgaaucggcgucguucacugacgucguccccacgggac   -u     uc    uc   uc 


Annotation confidence Medium
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Genome context
ref|NC_057010.1|: 1588123-1589016 [+]

Database links

Mature cre-miR914-5p

Accession MIMAT0060763
Description Chlamydomonas reinhardtii cre-miR914-5p mature miRNA
Sequence 155 - AGCUGCAACUCGCCCGGGCACC - 176
Evidence experimental
unknown

Mature cre-miR914-3p

Accession MIMAT0004397
Description Chlamydomonas reinhardtii cre-miR914-3p mature miRNA
Sequence 719 - GGUGCCCGGGCGAGUUGCAGCU - 740
Evidence experimental
cloned [1]

References

  1. PubMed ID: 17470535
    A complex system of small RNAs in the unicellular green alga Chlamydomonas reinhardtii
    "Zhao T, Li G, Mi S, Li S, Hannon GJ, Wang XJ, Qi Y"
    "Genes Dev (2007) 21:1190-1203