Accession
MI0008295
Description
Oryza sativa
osa-MIR1882h precursor miRNA
Sequence
34672
reads,
149.0
reads per million, 108 experiments
caugucuagaaaucuguuaucguuaccaauuuccuAGAUUGCUUUCAAGGUCAUUUCUUucugaaaccccguucccauaaauucaguauccaaagcugguuguuguaucuauggaaauaaggguuucagaauGAAAUGAUCUUGGACGCAAUCUAGgaguuugcugacgauaacguuaggggucuagugcaau
..((((((((..(((((((((((((.(((.((((((((((((.((((((((((((((.(((((((((((.(((.(((((.((.(((((.(((....))).))))).)).))))).)))..))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))).))).))))))))))...)))..))))).)))..
..((((((((..(((((((((((((.(((.((((((((((((.((((((((((((((.(((((((((((.(((.(((((.((.(((((.(((....))).))))).)).))))).)))..))))))))))).)))))))))))))).)))))))))))).))).))))))))))...)))..))))).)))..
Structure
ca - aa --- c u U U -c c a u u a ugu cuaga ucu guuaucguua caa uuccuAGAUUGC UUCAAGGUCAUUUC Uucugaaaccc guu ccaua au cagua cca a ||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| acg gaucu gga caauagcagu guu gagGAUCUAACG AGGUUCUAGUAAAG aagacuuuggg uaa gguau ua guugu ggu g ua u gg uug c u C u aa a c u u c
Annotation confidence
Medium
Do you think this miRNA is real?
Genome context
12: 21511519-21511711 [+]
Database links
Mature osa-miR1882h-5p
| Accession | MIMAT0007846 |
| Description | Oryza sativa osa-miR1882h-5p mature miRNA |
| Sequence | 36 - AGAUUGCUUUCAAGGUCAUUUCUU - 59 |
| Evidence |
experimental
454 [1] |
Mature osa-miR1882h-3p
| Accession | MIMAT0056092 |
| Description | Oryza sativa osa-miR1882h-3p mature miRNA |
| Sequence | 133 - GAAAUGAUCUUGGACGCAAUCUAG - 156 |
| Evidence |
experimental
unknown |
References
|
