Accession
MI0014601
Description
Arabidopsis lyrata
aly-MIR822 precursor miRNA
Sequence
6778
reads,
1481.0
reads per million, 12 experiments
auggggauguaacgcauguuguuuucugcgaggagcauuuguacauguuUCAUGUAGCAUGAAAUCACAUUCCauacaugaauaguaauuaccuuagauaggacauuguacugcuugaaaaaacuuguuaacgucauaaaauuuaugaugaaaacaccuauaaaaaguguuuuuucaagcauguguccaugagaguaauuuuuauucauauaugacaugugauuucauccuucauaAAAUGUGUGCAAAUGCUUUCCacaggaaacaacauacguuacaucccaucua
...(((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((((((((((((((.(((.((.((((((((((((..((((.((((((((.((((((((((....((((((.....(((((((((((((.((((..((((((((...))))))))..))))............))))))))))))).)))))).)))).)))))).)))))))).))))..)))))))))))).)).))).))))))))))))))))))).).))))))))))))).))))))))))).....
...(((((((((((.(((((((((((((.(.(((((((((((((((((((.(((.((.((((((((((((..((((.((((((((.((((((((((....((((((.....(((((((((((((.((((..((((((((...))))))))..))))............))))))))))))).)))))).)))).)))))).)))))))).))))..)))))))))))).)).))).))))))))))))))))))).).))))))))))))).))))))))))).....
Structure
--aug c c a C U C UC c u - gaua uguac -----------u aa a
gggauguaacg auguuguuuucug g ggagcauuuguacauguuU AUG AG AUGAAAUCACAU Caua augaauag aauuac cuua ggacau ugcuugaaaaaac uguu cgucauaa
||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| a
cccuacauugc uacaacaaaggac C UUUCGUAAACGUGUGUAAA uac uc uacuuuagugua guau uacuuauu uuaaug gagu ccugug acgaacuuuuuug acaa guaguauu
aucua a a C a u c ca a u a ---a ----u ugaaaaauaucc aa u
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
GL348718.1: 1060462-1060749 [-]
Database links
Mature aly-miR822-5p
| Accession | MIMAT0017599 |
| Description | Arabidopsis lyrata aly-miR822-5p mature miRNA |
| Sequence | 50 - UCAUGUAGCAUGAAAUCACAUUCC - 73 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1], SOLiD [2] |
| Database links |
|
Mature aly-miR822-3p
| Accession | MIMAT0017600 |
| Description | Arabidopsis lyrata aly-miR822-3p mature miRNA |
| Sequence | 237 - AAAUGUGUGCAAAUGCUUUCC - 257 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1], SOLiD [2] |
References
|
