Accession
MI0014669
Description
Arabidopsis thaliana
ath-MIR841b precursor miRNA MIR841
Gene
family?
family?
RF04139;
MIR841
Literature search
6 open access papers mention ath-MIR841b
(9 sentences)
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Sequence
uccucaucuccucuaaccgccaacugcaaaugccuuggaguuauccucuucacuuucaaauccuuguuaguguuuucggccaacugaagaaccucaguaguuaggcauucaaggauugaagucguguagacaacaucagucgcaccaacaguaccaugugcagaaacucuggucuuaaguugcuugugaaUACGAGCCACUGGAAACUGAAagaaacaaagaaacaauaucaguauaaaauuucaucaaauuagacuacaaaaaaugaaauuucuuuguuuauuuCAAUUUCUAGUGGGUCGUAUUcacauacaacucaagacuagaguaucuacaacauggucuacuuggugcuauuguuguugacuacacgccuucaauccuaaagugccuaauuucauagguuauugaguuacuuagaaacacaagcaaugauaagaaaaugaagaggauuacuccaaugcauugauaguuggugaucgcaggagauaagga
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Structure
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uccu aucuccu cgccaacug aaugc uuggagu auccucuuca uuuc auc uuguu guguuuu aacu aa aaccu g aguuaggcauu aggauugaag cguguag caaca cagu gcaccaa ag accaugu g aga acucuggucuu aguug ugugaaUACGA CCACUGGAAA UGAAa aaacaaagaa auuucau a
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Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr4: 2184135-2184629 [+]
Clustered miRNAs
1 other miRNA is < 10 kb from ath-MIR841b
| Name | Accession | Chromosome | Start | End | Strand | Confidence |
|---|
Database links
Mature ath-miR841b-5p
| Accession | MIMAT0017741 |
| Description | Arabidopsis thaliana ath-miR841b-5p mature miRNA |
| Sequence | 191 - UACGAGCCACUGGAAACUGAA - 211 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
Mature ath-miR841b-3p
| Accession | MIMAT0017742 |
| Description | Arabidopsis thaliana ath-miR841b-3p mature miRNA |
| Sequence | 286 - CAAUUUCUAGUGGGUCGUAUU - 306 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
