Accession
MI0019223
Description
Arabidopsis thaliana
ath-MIR5647 precursor miRNA
Sequence
11554
reads,
68.0
reads per million, 183 experiments
auuaaauccucaagaaccauacagcuugauaugagagucuucaaaccugagucgccaacaaacuuaacccccuuuaaauauauacaaaagguaaagaAACCAAUUUUGAUUUCGGAUGAUaaaagacaacacaauggagauuuaaauccaccaaagucgcacaaaaauagaacaagauaggcaucuuaacucucuaacguuuuuuagagucuuuggaaccuuaguuaugaugccuuucucgcucuauacauguucgaauuuggugaauuugacucucuaauguguuguauuugauaauccaaauucaaaaucgguuucuauaccuugugucaaugcuauguauuuagagaaggUCAAGUUUGAUGACGAUUCCAuuuuggagacucucuaauuaaguuguccuauucuugaggauuuaac
.(((((((((((((((....((((((((((..(((((((((((((...((((((.((.(((((((.(((..(((((((((((((((.((((((.(((((((.(((((((.((.((((....(((.((((((((.((((((.((((((.(((((((.(((.(((...(((((.(.(((.(((((((.(((((((((((......)))))).............))))).))))))).))).).)))))...))).))).))))))).)))))).)))))).)))))))).)))....)))).)).))))))).))))))).)))))).))).......))))))))))))..))).))))))).)).))))))...)))))))))))))..))))))))))....))))))))))))))).
.(((((((((((((((....((((((((((..(((((((((((((...((((((.((.(((((((.(((..(((((((((((((((.((((((.(((((((.(((((((.((.((((....(((.((((((((.((((((.((((((.(((((((.(((.(((...(((((.(.(((.(((((((.(((((((((((......)))))).............))))).))))))).))).).)))))...))).))).))))))).)))))).)))))).)))))))).)))....)))).)).))))))).))))))).)))))).))).......))))))))))))..))).))))))).)).))))))...)))))))))))))..))))))))))....))))))))))))))).
Structure
a ccau au ccu c a a cc ------- a a A U C GAUa g a u c g c aaa a a u u ------------- cg uuaaauccucaagaa acagcuugau gagagucuucaaa gagucg ca caaacuu acc cuuuaaauauau aca aaggua agaAACC AUUUUGA UU GGAU aaa acaacaca uggaga uuaaau caccaaa ucg aca auaga c aga aggcauc uaacu cucuaa u ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||| | ||| ||||||| ||||| |||||| aauuuaggaguucuu uguugaauua cucucagagguuu CUUAGC GU GUUUGAA Ugg gagauuuaugua ugu uuccau ucuuugg uaaaacu aa ccua uuu uguugugu aucucu aguuua gugguuu agc ugu uaucu g ucu uccguag auuga gagauu u c aucc au uAC A A C aa ucguaac g a c u a auag a a c a a u aca c c u u uuccaagguuucu uu
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr1: 22084264-22084683 [-]
Database links
Mature ath-miR5647-5p
| Accession | MIMAT0053940 |
| Description | Arabidopsis thaliana ath-miR5647-5p mature miRNA |
| Sequence | 98 - AACCAAUUUUGAUUUCGGAUGAU - 120 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature ath-miR5647-3p
| Accession | MIMAT0022411 |
| Description | Arabidopsis thaliana ath-miR5647-3p mature miRNA |
| Sequence | 354 - UCAAGUUUGAUGACGAUUCCA - 374 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
