Accession
MI0019235
Description
Arabidopsis thaliana
ath-MIR5652 precursor miRNA
Sequence
caugaauuagagugUUGAAUGUGAAUGAAUCGGGCugauaucccauuuccaccaucugaccaacaagagauacggcaucugaaauccuauucccgugacagaaaccauugagcagagaguuaagcgugacaauaucgggcucauagccgaguuucaucaucuuggcaagaacagcuaaagcaagagagagcugagagcgucggcagaaacaguugaugagaauacuguauguguaaagauuaugugaaauucccaaauuuugcaucugcucgccgagagagaugacaagaucgaacuuguucaucuuagcaauggcacucaacaguuuacugaacucaacaaucgaagggaaaggacgagacuugaccaugucaccgaacagauuaaccgcaucaucuagcuucaaaucauuuagccuauuuaucgauauuuuucuguaaucauaucu
.((((.(((.((....((((((..((((((.(((((((................(((........)))(((.(((.(((((...((((.(((((.((((((((((..(((((...(..((((((.(((((((..(((((((...))))(((((((((.(((((.(((...((((((..(((........))).))..(((((((.......)))))))......))))...))).)))))...)))))))))....(((((((((((.(((.....)))))))).)))))))))..))).))))))))))..)....)))))..)))).)))..........)))..)))))))))...(((........)))......)))))...))).))).................)))))))))))))..))))))..)).)))))))....
.((((.(((.((....((((((..((((((.(((((((................(((........)))(((.(((.(((((...((((.(((((.((((((((((..(((((...(..((((((.(((((((..(((((((...))))(((((((((.(((((.(((...((((((..(((........))).))..(((((((.......)))))))......))))...))).)))))...)))))))))....(((((((((((.(((.....)))))))).)))))))))..))).))))))))))..)....)))))..)))).)))..........)))..)))))))))...(((........)))......)))))...))).))).................)))))))))))))..))))))..)).)))))))....
Structure
---c a g ugUU GA C uaucccauuuccaccaucugaccaacaaga a --c --------------------aaa a -g ---------- - ca -cag ga c - ua ----------------------------ggcucauagcc --c g aga cuaaagcaagagagagcugagagc
auga uua ag GAAUGU AUGAAU GGGCuga gau cgg aucug uccu uuccc uga cag aaac uugag a guuaag guga caa ucg gaguuucau aucuu gca acag g
|||| ||| || |||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||| ||||| | |||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||
uacu aau uc uuuaua uauuua uccgauu cua gcc uagac agga aaggg gcu guc uuug aacuc u cgauuc uacu guu agc cuuaaagug uagaa ugu uguc u
ucua - g --uu gc - -------------uacuaaacuucgaucua c aau aagccacuguaccaguucagagc - aa aacaacucaa a ac acgg aa - u ca uagaacaguagagagagccgcucgucuacguuuuaaacc uau a gua auaagaguaguugacaaagacggc
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr1: 23412989-23413436 [-]
Database links
Mature ath-miR5652
| Accession | MIMAT0022424 |
| Description | Arabidopsis thaliana ath-miR5652 mature miRNA |
| Sequence | 15 - UUGAAUGUGAAUGAAUCGGGC - 35 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
