Accession
MI0027792
Description
Gossypium raimondii
gra-MIR8674b precursor miRNA
Sequence
1611
reads,
311.0
reads per million, 13 experiments
aucuuuccuaucacauuauccauggucucuuuccaaguauuuaaugacauaucugaauuuuuuuccaugccauuaacacauaauuuugguaaguuguuccuucagcccuaaaucuagaaccuugaaccccaaaucugaacaccgaaucCAAACCUUGAACCUCGAAuuuuaaacccuaaacucaaacccaaacccuaaauccuaaaacuuaaguucaagguuuaggguucaaauuuggggcucaagguuuagguucgagguugaagguuugggcuuaggguuuaagguuuaggguuuuggguucaagguuuaagauucaagauuuaagauucagaguuggggguucuagguuuaagguucaagguaaaagaaaauuauaaaaauuaugugucaaugacauaaaaaaauuguuaaaaugucauuaaauaaUUAGAAAUGGACCAUGGAUGAUGUggggguaaga
.((((.(((.((((((((((((((((((.((((.((.(((((((((((((.....(((((((((..(((.((((.((((((((((((.((((.((.((((((.((((.(((((((((((((((.((((((((((((((((.((...((((((((((.((((((((((((.(((((.....((((((....(((((((((.(((..(((....)))..))))))))))))....))))))......))))))))))))))))).))))))))))....)))))).)))))).))).((((((((..((((((........))))))..))))))))))).))))))))))))))).)))).))))...)).))..)))).)))))))))))).)))).))))))))))))......))))))))))))).)).)))).))))))))))))))))))))).))))
.((((.(((.((((((((((((((((((.((((.((.(((((((((((((.....(((((((((..(((.((((.((((((((((((.((((.((.((((((.((((.(((((((((((((((.((((((((((((((((.((...((((((((((.((((((((((((.(((((.....((((((....(((((((((.(((..(((....)))..))))))))))))....))))))......))))))))))))))))).))))))))))....)))))).)))))).))).((((((((..((((((........))))))..))))))))))).))))))))))))))).)))).))))...)).))..)))).)))))))))))).)))).))))))))))))......))))))))))))).)).)))).))))))))))))))))))))).))))
Structure
a u a c c g -aucug cc c a g -g g --- c c g ----------------------------------------- - - a -gaa G u -cuaaa ccca u aa u ucuu ccu ucacauuauccauggucu uuuc aa uauuuaaugacau aauuuuuuu aug cauu acacauaauuuu guaa uu uu ccuu agcc uaaaucuagaaccuu aac ccc aaaucu gaac cc ucCAAACCUU AACCUCGAAuuu aaacc cucaaa aacccuaaa ccu aac u |||| ||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || || |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||| agaa ggg ggUGUAGUAGGUACCAGG AAAG UU auaaauuacugua uuaaaaaaa uac guaa uguguauuaaaa uauu aa aa ggaa uugg auuuggaucuugggg uug ggg uuugga uuug gg ggguuuggaa uuggagcuugga uuugg ggguuu uugggauuu gga uug a - u - U A a aaauug -- a c a aa g aau c a g agacuuagaauuuagaacuuagaauuuggaacuuggguuuu a a - auuc g - aacucg aaac - ac a
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr8: 8534158-8534620 [+]
Database links
Mature gra-miR8674b-5p
| Accession | MIMAT0055508 |
| Description | Gossypium raimondii gra-miR8674b-5p mature miRNA |
| Sequence | 149 - CAAACCUUGAACCUCGAA - 166 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature gra-miR8674b-3p
| Accession | MIMAT0034197 |
| Description | Gossypium raimondii gra-miR8674b-3p mature miRNA |
| Sequence | 430 - UUAGAAAUGGACCAUGGAUGAUGU - 453 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
