Accession
MI0027808
Description
Gossypium raimondii
gra-MIR8775 precursor miRNA
Sequence
gagacuucaaUUGUGAGAUUGAAGCUGAUGGgaaagugguaauaaagggauccuaaaaacucgugagaaaauaguaugcaaggacuuugaaauuuuucuucacaauugcuucaagcauuccguuuuccaaauaagugguugguucuugguuauugacgggaccaaguagcuugaaugagaugaagcgugucggugggcauagauuuugugugagcauaagaaaauuuucaaagccccugaauacuauuugcucccccauuguuaguaucccccuuauuaccauuucuucaucaacuuuaaucucacaauugaagucucu
((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((.(((((.((((........(((.(((((((((.((.((.((((((((.(((((((((((...((((((..(((((......(((......)))..(((((((((((........))))))).)))).)))))...))))))(((((....)))))........))))).....)))))).)))))))).)).)).))))))))).)))........)))).)))))..)))))))))))).))))))).)))))))))))))))))))))))).
((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((.(((((.((((........(((.(((((((((.((.((.((((((((.(((((((((((...((((((..(((((......(((......)))..(((((((((((........))))))).)))).)))))...))))))(((((....)))))........))))).....)))))).)))))))).)).)).))))))))).)))........)))).)))))..)))))))))))).))))))).)))))))))))))))))))))))).
Structure
- C a -a c aaacucgu a g a a u ----- -------------------auu -ag cguuuuccaaauaagugguu - auu gagacuucaaUUGUGAGAUUGAAG UGAUGGg aagugguaauaa gggau cuaa gag aaauaguau ca gg cuuugaaa uuuucu ucaca gcuuca cauuc gguu cuugguu g |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| || || |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||| cucugaaguuaacacucuaauuuc acuacuu uuuaccauuauu cccua gauu cuc uuuaucaua gu cc gaaacuuu aaaaga agugu cgaagu guaag ucga gaaccag a u a c cc u guuacccc g a c c u auacg guuuuagauacggguggcugug aga -------------------u u ggc
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr13: 51821710-51822028 [-]
Clustered miRNAs
2 other miRNAs are < 10 kb from gra-MIR8775
| Name | Accession | Chromosome | Start | End | Strand | Confidence |
|---|
Database links
Mature gra-miR8775
| Accession | MIMAT0034213 |
| Description | Gossypium raimondii gra-miR8775 mature miRNA |
| Sequence | 11 - UUGUGAGAUUGAAGCUGAUGG - 31 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
