Accession
MI0027860
Description
Gossypium raimondii
gra-MIR8689 precursor miRNA
Sequence
guugaggaguAGAGGUGCUCAUGGGCUGGGUCGGgccaggccccaaaaaauucagcucgaguccuaggccagagcucaacucgacucaaaauaugggcuugaaauuuuguccaggcccggcccaagaaaaaaaucuuaagcccgagcccggcccgacccauuuuuuaaauaaaacaccaaaaauuuauuuuaaaauaaaaaauaaaaaaauauuuuaaaaauaauaaaaauauauauauuuauuauuuauucgggccgggcagagcagggcccgggccaaaaaaguagugcccgaggcccgacccauuuuuuaaacaggccucguuuuuuuugcccaagcucauauuucgagccuauauuuuuauccgaacccucucauauuucggacuggccgucggaccaggccgggucgggccgcccgacccaugaucaccucuauugaggagucaauuaaugaauauaucccaaa
(((((..((((((((((.(((((((.((((.(((.((.(((((...........(((.(.((((..((((((((.((.....)))))((((((((((((((((((...((...((((((((..((((......))))..)))...(((((((((((.....((((.(((((((..........))))))).))))...((((((......))))))..((((((((((.((....)).))))))))))..)))))))))))......))))).((((.(((((((.......(((((((..................)))))))))))))).))))..))....))))))))))))))))))..((((((...........)))))).)))))...))))).))).))))))).))))))).))))))).))))))))))......)))))..................
(((((..((((((((((.(((((((.((((.(((.((.(((((...........(((.(.((((..((((((((.((.....)))))((((((((((((((((((...((...((((((((..((((......))))..)))...(((((((((((.....((((.(((((((..........))))))).))))...((((((......))))))..((((((((((.((....)).))))))))))..)))))))))))......))))).((((.(((((((.......(((((((..................)))))))))))))).))))..))....))))))))))))))))))..((((((...........)))))).)))))...))))).))).))))))).))))))).))))))).))))))))))......)))))..................
Structure
------------------ ----gg C C U g a caaaaaauuca c a -ua ----------gagcucaacucgacuc -uuu ccaggcccggcccaagaaaaaaaucuuaagcccgagcccggcccgacccauuuuuuaaauaaaacaccaaaaauuuauuuuaaaauaaaaaauaaaaaaauauuuuaaaaauaauaaaaauauauauauuuauuauuuauucgggccgggcagagcagggccc c uagugcc cgacccau
guuga aguAGAGGUG UCAUGGG UGGG CGG cc ggccc gcu g gucc ggcca aaaauaugggcuugaaau gu gggc aaaaaag cgaggcc u
||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||
uaacu uuaucuccac aguaccc gccc gcc gg cuggg cgg c cagg ccggu uuuuauauccgagcuuua cg cccg uuuuuuu gcuccgg u
aaacccuauauaaguaau gaggag u a - g - ----------c a - cug caggcuuuauacucucccaagccuau uacu -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------aa u ------- acaaauuu
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr9: 30068577-30069045 [+]
Database links
Mature gra-miR8689
| Accession | MIMAT0034265 |
| Description | Gossypium raimondii gra-miR8689 mature miRNA |
| Sequence | 11 - AGAGGUGCUCAUGGGCUGGGUCGG - 34 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
