Accession
MI0033505
Description
Glycine max
gma-MIR10440 precursor miRNA
Sequence
3969109
reads,
6026.0
reads per million, 178 experiments
augauuggaagguuuauguuauauaUCUGAAGUAUUGUCCCAAUGAUcauuaaaguauaauggucaaauugugcucuuugguuaacaaagucuuucuuguguaagaauuuaauguuacaaggaguuguuagauaaccuuaacaaguuauuuaacacuaaacuuugacagagaaaagauuauguucaccaaagaaacaagcuugugauguuucugaucuugaacauugucuuuacccuuugaugaucauugguguuucugaucuugaacauugucuuuacccuuugaugaucaUUGGGACAAUACUUUAGAUAUauaacaaaaaucuucuaacaaucau
(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......)))))))((((((((.((((.(((((((.((.(((.(((.((((.(((((....((.(((((((......))))))).))...))))).)))).))).))).)).))))))).)))).)))))))).(((....)))(((((((..((((..((((((((((.(((.....))).)))....)))))))..))))..)))))))..........)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))...)))))))
(((((((((((((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((......)))))))((((((((.((((.(((((((.((.(((.(((.((((.(((((....((.(((((((......))))))).))...))))).)))).))).))).)).))))))).)))).)))))))).(((....)))(((((((..((((..((((((((((.(((.....))).)))....)))))))..))))..)))))))..........)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))))))...)))))))
Structure
--- a --------------------------------------------------------------------guauaauggucaaauugugc u a c g a a a caag g au
augauug gaagguuu uguuauauaUCUGAAGUAUUGUCCCAAUGAUcauuaaa ucuuuggu aaca agucuuu uu ugu aga uuua uguua ga uuguuag a
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||| ||| |||| ||||| || |||||||
uacuaac cuucuaaa acaauaUAUAGAUUUCAUAACAGGGUUacuaguaguuu agaaacca uugu uuagaaa ga aca uuu aaau acaau uu aacaauu a
aau a cccauuucuguuacaaguucuagucuuugugguuacuaguaguuucccauuucuguuacaaguucuagucuuuguaguguucgaacaa c a a g g c c -uua g cc
Annotation confidence
High
Do you think this miRNA is real?
Genome context
chr18: 48514053-48514390 [+]
Database links
Mature gma-miR10440-5p
| Accession | MIMAT0054553 |
| Description | Glycine max gma-miR10440-5p mature miRNA |
| Sequence | 26 - UCUGAAGUAUUGUCCCAAUGAU - 47 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature gma-miR10440-3p
| Accession | MIMAT0041713 |
| Description | Glycine max gma-miR10440-3p mature miRNA |
| Sequence | 293 - UUGGGACAAUACUUUAGAUAU - 313 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
