Accession
MI0036362
Description
Fragaria vesca
fve-MIR159c precursor miRNA
Sequence
789982
reads,
59238.0
reads per million, 18 experiments
gagauacauguuaguugugaaaggagcuuccuucaauccaauugagagggcuagacagugguuugagCUGUCAAAUCAUGCACUCGGCucacccuuaaucgucauggaaaguaugaugcuaaggguuugccaguugcaugauaugagagcaacucugccgcugcuuguauuucccAUUGGAUUGAAGGGAGCUCCCucauuaacucaguguagcuu
(((.(((((...((((((((..((((((((((((((((((((.(.(((.((.((.(((((((..(((((.(((.((((((((((.(((..(((((((..(((((((.....))))))).)))))))..))))).)))))))).))).)))...)).))))))))).))..)))).)))))))))))))))))))).))).)))))..))))).)))
(((.(((((...((((((((..((((((((((((((((((((.(.(((.((.((.(((((((..(((((.(((.((((((((((.(((..(((((((..(((((((.....))))))).)))))))..))))).)))))))).))).)))...)).))))))))).))..)))).)))))))))))))))))))).))).)))))..))))).)))
Structure
a guu - aa u a -g u a uu --- G A - C uc au g gag uacau aguug uga ggagcuuccuucaauccaau g gag gc ag caguggu ga gCU UCA AUCAUGCA CU GGC acccuua cgucaug a ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || || ||||||| || ||| ||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||| a uuc augug ucaau acu CCUCGAGGGAAGUUAGGUUA c cuu ug uc gucgccg cu cga agu uaguacgu ga ccg ugggaau guaguau a g -ac u -C c - ua u - -u caa g a u - uu -c g
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Genome context
LG6: 2332525-2332740 [+]
Database links
Mature fve-miR159c-5p
| Accession | MIMAT0060505 |
| Description | Fragaria vesca fve-miR159c-5p mature miRNA |
| Sequence | 68 - CUGUCAAAUCAUGCACUCGGC - 88 |
| Evidence |
experimental
unknown |
Mature fve-miR159c-3p
| Accession | MIMAT0044490 |
| Description | Fragaria vesca fve-miR159c-3p mature miRNA |
| Sequence | 176 - AUUGGAUUGAAGGGAGCUCCC - 196 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
