Accession
MI0036787
Description
Picea abies
pab-MIR946a precursor miRNA
Literature search
1 open access papers mention pab-MIR946a
(4 sentences)
(4 sentences)
Sequence
aauugaugcguucacaguguacagaUGUGGAUAUAGGAGGGUUAGUuagcacauauauacaaaacccauuuaauagagauucugugagagcaucuuauuguagauuguuggcuauucgagaucaaacaaccguguucaaucaacuuauuguagauuguuggcuauucgagaucaaacaaccguguucaaucaaaugcauuuugauggccauacucaucaaauggguugccuguuugucuuuaccagcccuucugcuauccacaaccguaguaguuuguucacaucaauu
((((((((.(..((.(.(((((.(.((((((((((((((((((.((.((.(((.(((.....(((((((((.((.(((..(((.(((((((((((......)))).....))).)))))))...((((....))))(((((.((.....)).))))).(((((((.((((((((((((....))))........)).)))))))))))))..))))).)))))))))...))).)))))..)).)))))))))).)))))))).).))).)).).))..).))))))))
((((((((.(..((.(.(((((.(.((((((((((((((((((.((.((.(((.(((.....(((((((((.((.(((..(((.(((((((((((......)))).....))).)))))))...((((....))))(((((.((.....)).))))).(((((((.((((((((((((....))))........)).)))))))))))))..))))).)))))))))...))).)))))..)).)))))))))).)))))))).).))).)).).))..).))))))))
Structure
c uu c g - a a - A -u c u uacaa a a -----------------------------------------------------------------------------------------au g - ----- ua
aauugaug g ca a ug uac g UGUGGAUA UAGGAGGGUU GU ag aca aua aacccauuu au gag ucu ugag agc aucu u
|||||||| | || | || ||| | |||||||| |||||||||| || || ||| ||| ||||||||| || ||| ||| |||| ||| ||||
uuaacuac c gu u au aug c acaccuau gucuucccga ca uc ugu ugu uuggguaaa ua cuc aga gcuu ucg uaga u
a uu u g g c a c c uu - u --ccg c - auaccgguaguuuuacguaaacuaacuugugccaacaaacuagagcuuaucgguuguuagauguuauucaacuaacuugugccaacaaacu - a guugu ug
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
MA_10431262: 8431-8719 [-]
Database links
Mature pab-miR946a
| Accession | MIMAT0044885 |
| Description | Picea abies pab-miR946a mature miRNA |
| Sequence | 26 - UGUGGAUAUAGGAGGGUUAGU - 46 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
