Accession
MI0036792
Description
Picea abies
pab-MIR946f precursor miRNA
Literature search
1 open access papers mention pab-MIR946f
(4 sentences)
(4 sentences)
Sequence
uugaugcguucacaguguacagaUGUGGAUAUAGGAGGGUUAGUuagcacauauauacaaaacccauuuaauagaguuucugugagagcaucuuauuguagauuguuggcuauucgagaucaaacaacuuauuguagauuguuggcuauucgagaucaaacaaccguguucaaucaacugcauuuugauggccauacucaucaaaugguuugccuguuugucuuuaccagcccuuaugcuauccacaaccuuauuaguagauuguugacuguucaa
.(((.(((.(((((((.(((((.((((((((((.(((((((.((.((.(((.(((..((((..((((((.((.((((.(((.(((((((((((......)))).....))).)))))))...(((((((......)).)))))((((((.((((((((((((....))))........)).))))))))))))..)))))).))))))))))..))).)))))..)).))))))).)).))))))))..)).....))).)))).))).)))))).
.(((.(((.(((((((.(((((.((((((((((.(((((((.((.((.(((.(((..((((..((((((.((.((((.(((.(((((((((((......)))).....))).)))))))...(((((((......)).)))))((((((.((((((((((((....))))........)).))))))))))))..)))))).))))))))))..))).)))))..)).))))))).)).))))))))..)).....))).)))).))).)))))).
Structure
u u u - g ----- -a - G A -u c u ua ac a a ---------------------------------------------------------------------------u g - ----- ua uga gcg uca cagu uac ag UGUGGAUA UA GAGGGUU GU ag aca aua caaa ccauuu au gagu ucu ugag agc aucu u ||| ||| ||| |||| ||| || |||||||| || ||||||| || || ||| ||| |||| |||||| || |||| ||| |||| ||| |||| acu ugu agu guua aug uc acaccuau gu uucccga ca uc ugu ugu guuu gguaaa ua cuca aga gcuu ucg uaga u a - c u g auuau ca c a c uu - u cc -- c - uaccgguaguuuuacgucaacuaacuugugccaacaaacuagagcuuaucgguuguuagauguuauucaacaaacu - a guugu ug
Annotation confidence
Not enough data
Do you think this miRNA is real?
Genome context
MA_10433553: 989-1264 [-]
Database links
Mature pab-miR946f
| Accession | MIMAT0044890 |
| Description | Picea abies pab-miR946f mature miRNA |
| Sequence | 24 - UGUGGAUAUAGGAGGGUUAGU - 44 |
| Evidence |
experimental
Illumina [1] |
References
|
