Accession
MI0006211
Description
Chlamydomonas reinhardtii
cre-MIR1150 precursor miRNA
Sequence
22550
reads,
1335.0
reads per million, 51 experiments
ggacgcgcagcggagcagauccccgucauaccccgcuuggugcagcgcgucaauaucccucuuggcgagcUUCGCAAAUAGAGUCGGCCCCaguuuccgcugcagcugggcuucgugcuuccagcuuccugcacggcucgccguccgagcgccuugcuugccgcccgauacgcaguucggauucguauacgcauaucgaacucaauccgagucgcguaucaucggguggcaaggaaggcgcuggaagccucugacagcgagccaugcaggaagcugaaagccugaaagcccaccugcagcggcgacuggggccgacccuguuugcaaagcucgccgAGAGGGACAUUGAUGCGCUGCaccaagcgggguaugacggggauacgcuccgcuucgcgucc
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Structure
c ag a C A u c - u c c c -------- g g --- a ----- - a
ggacgcg agcggagc auccccgucauaccccgcuuggugcagcgcgucaau ucccucuuggcgagcUU GCAAAUAG GUCGGCCCCaguu ccgcugcag ugggcuu cg gcuu cagcuuccugca ggcucgc guc c agcgccuu cuugccgcccga uacgc guucggau ucg uau c
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u ca C a c c c a c a a a ucuccgaa g g acu c acuca u c
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Comments
Molner et al. identified a number of offset and overlapping mature miRNA products frmo this hairpin precursor [1]. The predominant ones are named and shown here.
Genome context
ref|NC_057010.1|: 2591459-2591856 [-]
Database links
Mature cre-miR1150-5p
| Accession | MIMAT0005390 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR1150-5p mature miRNA |
| Sequence | 71 - UUCGCAAAUAGAGUCGGCCCC - 91 |
| Evidence |
experimental
cloned [1] |
Mature cre-miR1150-3p
| Accession | MIMAT0005392 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR1150-3p mature miRNA |
| Sequence | 337 - AGAGGGACAUUGAUGCGCUGC - 357 |
| Evidence |
experimental
cloned [1] |
References
|
