Accession
MI0006224
Description
Chlamydomonas reinhardtii
cre-MIR1163 precursor miRNA
Sequence
23922
reads,
1226.0
reads per million, 47 experiments
auugacaacgcgcccgagcgccggcgcaccggcaagaacaaggacaaguaugagaugcugccguaccccggcaacacgcucauggaUGAGGCUGACCUGAAGGGCAUgcugcgugccauggcgcccuucaucgugcgcgcauagggucuuaacugccagguugaagucgcacacgcggaagaccuugcugccaucaggcgcgaugucguacagcagguuggcgggcuucaggucaaagugcauguagccgcgagcguucaggugcuuugaugaagagcgccauggcacgcagcaugCCCUUCAGGUCGGCCUCAUCCauaagcguguugccgggguacggcagcaucucaaacuuguccuuguucuugccggugcgccggcgcucgggcgcguugucaau
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Structure
a c c -u gcauagggucuuaacugccagg gu aca aagaccuugcugccaucaggcgcgaugucg - gg ggg
auugacaacgcgcccgagcgccggcgcaccggcaagaacaaggacaagu ugagaugcugccguaccccggcaacacgcu auggaUGAGGCUGACCUGAAGGGCAUgcugcgugccauggcgc cuucaucg gcgc uugaa cgc cgcgg uaca gca uuggc c
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a a a uu ---------------------- -- --a -----------------------------g a ga gac
Annotation confidence
Medium
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Genome context
ref|NC_057015.1|: 5011150-5011549 [-]
Database links
Mature cre-miR1163-5p
| Accession | MIMAT0005417 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR1163-5p mature miRNA |
| Sequence | 87 - UGAGGCUGACCUGAAGGGCAU - 107 |
| Evidence |
experimental
cloned [1] |
Mature cre-miR1163-3p
| Accession | MIMAT0005418 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR1163-3p mature miRNA |
| Sequence | 297 - CCCUUCAGGUCGGCCUCAUCC - 317 |
| Evidence |
experimental
cloned [1] |
References
|
