Accession
MI0006232
Description
Chlamydomonas reinhardtii
cre-MIR1173 precursor miRNA
Sequence
23516
reads,
922.0
reads per million, 51 experiments
guuuggccugguguuuaauuugcuuccacacauuugcaaugccagcaaauugcgcaugccaaugcauuuauagguuauugcauacgcccuggauuggcagcgugagugaaagugugcugggcugcgugcuacuguagaugaguggguacuugcgaaauguauuggcggccauuguAUGGUUGCAAUAGAAAUCAUGcaggggauacugugaauuauauaccauguaccaugugcaauguuucagaugucccugcacuagcaggcauucagacaucccagcaucccagcgcuggcaggcaugccugaaacauugcacaugguacauaauucacaguauccccuucaugauuuccauuguaaccauacAAUGGCAGCCAAUACAUUUCUCaaguacccacucaucuguacagcagcacgcaccuucacucaugcugccaauccagggcguaugcuauaaccuauaaaugcuuuggcaugcacaauuugcuggcauuacaacuguguggaugcagauuaacuuguaaccacaaac
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Structure
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guuug uggu uuaauuugc uccacaca uug aaugccagcaaauug gcaugccaa gcauuuauagguuau gcauacgcccuggauuggcagcgugaguga ggg ugcgugcu cugu agaugaguggguacuug gaaauguauuggc gccauuguAUGGUUGCAAU GAAAUCAUG aggggauacugugaauua uguaccaugugcaauguuuca gauguc ccugc c
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--- auguuc u c a a u u --------- - c ug U A c u ------- ccguacggacggucgcgacccuacgacc acuuac a
Annotation confidence
Low
Do you think this miRNA is real?
Comments
Molner et al. cloned a number of additional minor products (cloned only once) from this hairpin precursor (not shown) [1].
Genome context
ref|NC_057010.1|: 688303-688834 [+]
Database links
Mature cre-miR1173-5p
| Accession | MIMAT0005431 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR1173-5p mature miRNA |
| Sequence | 176 - AUGGUUGCAAUAGAAAUCAUG - 196 |
| Evidence |
experimental
cloned [1] |
Mature cre-miR1173-3p
| Accession | MIMAT0060772 |
| Description | Chlamydomonas reinhardtii cre-miR1173-3p mature miRNA |
| Sequence | 367 - AAUGGCAGCCAAUACAUUUCUC - 388 |
| Evidence |
experimental
unknown |
References
|
