Search results

Drosophila pseudoobscura miRNAs

Name Accession RPM Chromosome Start End Strand Confidence
dps-bantam MI0001287 - ref|NC_046683.1| 64631104 64631184 + High
dps-let-7 MI0001288 - ref|NC_046681.1| 21485118 21485194 + High
dps-mir-1 MI0001289 - ref|NC_046681.1| 25707369 25707456 - High
dps-mir-2a-1 MI0001290 - ref|NC_046681.1| 15064456 15064529 + High
dps-mir-2a-2 MI0001291 - ref|NC_046681.1| 15065041 15065112 + High
dps-mir-2b-1 MI0001292 - ref|NC_046681.1| 21776080 21776156 + High
dps-mir-2b-2 MI0001293 - ref|NC_046681.1| 15064157 15064239 + High
dps-mir-2c MI0001294 - ref|NC_046679.1| 10185065 10185167 + High
dps-mir-3 MI0001295 - ref|NC_046680.1| 16472383 16472455 - -
dps-mir-4 MI0001296 - ref|NC_046680.1| 16472055 16472135 - High
dps-mir-iab-4 MI0001297 - ref|NC_046679.1| 18022055 18022122 + Medium
dps-mir-5 MI0001298 - ref|NC_046680.1| 16471877 16471948 - High
dps-mir-6-1 MI0001299 - ref|NC_046680.1| 16471735 16471814 - -
dps-mir-6-3 MI0001300 - ref|NC_046680.1| 16471441 16471520 - -
dps-mir-6-2 MI0001301 - ref|NC_046680.1| 16471584 16471666 - High
dps-mir-7 MI0001302 - ref|NC_046680.1| 12391382 12391469 - High
dps-mir-8 MI0001303 - ref|NC_046680.1| 14955760 14955846 + High
dps-mir-9a MI0001304 - ref|NC_046683.1| 61525386 61525463 - High
dps-mir-9b MI0001305 - ref|NC_046681.1| 26309882 26309972 + High
dps-mir-9c MI0001306 - ref|NC_046681.1| 26308896 26308987 + High
dps-mir-10 MI0001307 - ref|NC_046679.1| 20579805 20579881 + High
dps-mir-11 MI0001308 - ref|NC_046679.1| 24781962 24782032 - High
dps-mir-12 MI0001309 - ref|NC_046683.1| 21426542 21426615 - High
dps-mir-13a MI0001310 - ref|NC_046679.1| 10185305 10185378 + High
dps-mir-13b-1 MI0001311 - ref|NC_046679.1| 10185457 10185525 + High
dps-mir-13b-2 MI0001312 - ref|NC_046683.1| 11096047 11096115 + High
dps-mir-14 MI0001313 - ref|NC_046680.1| 19623233 19623295 + High
dps-mir-31a MI0001314 - ref|NC_046680.1| 20228182 20228273 - High
dps-mir-31b MI0001315 - ref|NC_046683.1| 9916847 9916935 + High
dps-mir-33 MI0001316 - ref|NC_046683.1| 48493164 48493254 + High
dps-mir-34 MI0001317 - ref|NC_046679.1| 5315193 5315292 - High
dps-mir-79 MI0001318 - ref|NC_046681.1| 26309687 26309770 + High
dps-mir-87 MI0001319 - ref|NC_046681.1| 18048222 18048319 + Medium
dps-mir-92a MI0001320 - ref|NC_046679.1| 24549955 24550048 - High
dps-mir-92b MI0001321 - ref|NC_046679.1| 24545290 24545389 - High
dps-mir-100 MI0001322 - ref|NC_046681.1| 21484265 21484364 + High
dps-mir-124 MI0001323 - ref|NC_046681.1| 28800135 28800232 - High
dps-mir-125 MI0001324 - ref|NC_046681.1| 21485468 21485577 + High
dps-mir-133 MI0001325 - ref|NC_046681.1| 25563773 25563868 - High
dps-mir-184 MI0001326 - ref|NC_046680.1| 4314020 4314119 + High
dps-mir-210a MI0001327 - ref|NC_046683.1| 38870244 38870337 - High
dps-mir-219 MI0001328 - ref|NC_046683.1| 51974353 51974452 - High
dps-mir-263a MI0001329 - ref|NC_046681.1| 25187759 25187850 + High
dps-mir-263b MI0001330 - ref|NC_046683.1| 46111991 46112081 - High
dps-mir-274 MI0001331 - ref|NC_046683.1| 52691329 52691425 - High
dps-mir-275 MI0001332 - ref|NC_046681.1| 10612491 10612580 - High
dps-mir-276a MI0001333 - ref|NC_046683.1| 51355465 51355563 + High
dps-mir-276b MI0001334 - ref|NC_046683.1| 51309767 51309865 + High
dps-mir-277 MI0001335 - ref|NC_046679.1| 5316219 5316318 - High
dps-mir-278 MI0001336 - ref|NC_046680.1| 23339855 23339952 - High
dps-mir-279 MI0001337 - ref|NC_046679.1| 2568504 2568598 - High
dps-mir-280 MI0001338 - ref|NC_046680.1| 5849551 5849644 + -
dps-mir-281-1 MI0001339 - ref|NC_046680.1| 4058560 4058647 - High
dps-mir-281-2 MI0001340 - ref|NC_046680.1| 4058356 4058446 - High
dps-mir-282 MI0001341 - ref|NC_046683.1| 59646870 59646963 - High
dps-mir-283 MI0001342 - ref|NC_046683.1| 21428481 21428577 - High
dps-mir-284 MI0001343 - ref|NC_046679.1| 1942455 1942554 + Medium
dps-mir-285 MI0001344 - ref|NC_046683.1| 44461102 44461201 - High
dps-mir-286 MI0001345 - ref|NC_046680.1| 16472217 16472313 - High
dps-mir-287 MI0001346 - ref|NC_046681.1| 28791447 28791526 - -
dps-mir-288 MI0001347 - ref|NC_046681.1| 25560408 25560503 + -
dps-mir-289 MI0001348 - ref|NC_046683.1| 62329671 62329770 + -
dps-mir-304 MI0001349 - ref|NC_046683.1| 21427151 21427238 - High
dps-mir-305 MI0001350 - ref|NC_046681.1| 10612359 10612431 - High
dps-mir-306 MI0001351 - ref|NC_046681.1| 26309521 26309599 + Medium
dps-mir-307a MI0001352 - ref|NC_046680.1| 17893999 17894086 - Medium
dps-mir-308 MI0001353 - ref|NC_046680.1| 20082201 20082262 - High
dps-mir-309 MI0001354 - ref|NC_046680.1| 16472517 16472584 - -
dps-mir-314 MI0001355 - ref|NC_046683.1| 64903573 64903661 + High
dps-mir-315 MI0001356 - ref|NC_046683.1| 46622272 46622355 - High
dps-mir-316 MI0001357 - ref|NC_046683.1| 47067181 47067269 + High
dps-mir-317 MI0001358 - ref|NC_046679.1| 5325657 5325746 - High
dps-mir-318 MI0001359 - ref|NC_046679.1| 7628026 7628093 - -
dps-mir-989 MI0011591 - ref|NC_046680.1| 6414744 6414863 - High
dps-mir-981 MI0011592 - ref|NC_046683.1| 40815572 40815660 + High
dps-mir-970 MI0011593 - ref|NC_046683.1| 41773433 41773520 - High
dps-mir-980 MI0011594 - ref|NC_046683.1| 14140956 14141063 + High
dps-mir-971 MI0011595 - ref|NC_046683.1| 38301433 38301526 - High
dps-mir-190 MI0011596 - ref|NC_046683.1| 67070433 67070526 + High
dps-mir-957 MI0011597 - ref|NC_046683.1| 56464390 56464486 + High
dps-mir-958 MI0011598 - ref|NC_046683.1| 56301301 56301400 + High
dps-mir-988 MI0011599 - ref|NC_046680.1| 4043301 4043405 - High
dps-mir-987 MI0011600 - ref|NC_046680.1| 13001963 13002075 - High
dps-mir-137 MI0011601 - ref|NC_046680.1| 20130574 20130684 - High
dps-mir-994 MI0011602 - ref|NC_046679.1| 7628178 7628284 - High
dps-mir-311 MI0011603 - ref|NC_046680.1| 12415464 12415574 + High
dps-mir-92c MI0011604 - ref|NC_046680.1| 12415613 12415727 + High
dps-mir-968 MI0011605 - ref|NC_046681.1| 12994506 12994622 - -
dps-mir-1002 MI0011606 - 4_group1 1722916 1723031 + -
dps-mir-965 MI0011607 - ref|NC_046681.1| 10418871 10418961 - High
dps-mir-1006 MI0011608 - ref|NC_046681.1| 20903167 20903248 + High
dps-mir-375 MI0011609 - ref|NC_046681.1| 23500202 23500290 + High
dps-mir-964 MI0011610 - ref|NC_046681.1| 6337672 6337789 + High
dps-mir-959 MI0011611 - ref|NC_046681.1| 6336564 6336675 + High
dps-mir-932 MI0011612 - ref|NC_046681.1| 14404825 14404942 + High
dps-mir-252 MI0011613 - ref|NC_046679.1| 17099186 17099295 - High
dps-mir-993 MI0011614 - ref|NC_046679.1| 20613840 20613953 - High
dps-mir-1000 MI0011615 - ref|NC_046679.1| 22035532 22035622 - High
dps-mir-929 MI0011616 - ref|NC_046679.1| 25591641 25591734 - High
dps-mir-927 MI0011617 - ref|NC_046683.1| 33825631 33825718 - High
dps-mir-995 MI0011618 - ref|NC_046679.1| 6219831 6219915 + High
dps-mir-1010 MI0011619 - ref|NC_046679.1| 12623757 12623862 + High
dps-mir-969 MI0011620 - ref|NC_046683.1| 38877171 38877282 - High
dps-mir-193 MI0011621 - ref|NC_046683.1| 45270046 45270147 - High
dps-mir-986 MI0011622 - ref|NC_046680.1| 5989116 5989207 + High
dps-mir-307b MI0011623 - ref|NC_046680.1| 17894001 17894085 + Medium
dps-mir-3983 MI0011624 - ref|NC_046681.1| 25187760 25187847 - Low
dps-mir-210b MI0011625 - ref|NC_046683.1| 38870244 38870352 + Medium
dps-mir-iab-8 MI0011626 - ref|NC_046679.1| 18022043 18022135 - Medium
dps-mir-2502 MI0011627 - ref|NC_046679.1| 17001509 17001620 - Medium
dps-mir-2503 MI0011628 - 2 17318675 17318788 - Medium
dps-mir-2504 MI0011629 - ref|NC_046679.1| 24500450 24500529 + -
dps-mir-2505 MI0011630 - ref|NC_046679.1| 26576982 26577059 + -
dps-mir-2506 MI0011631 - ref|NC_046680.1| 12415930 12416042 + High
dps-mir-2507a MI0011632 - ref|NC_046680.1| 12416262 12416369 + -
dps-mir-2508 MI0011633 - ref|NC_046681.1| 22132547 22132653 - High
dps-mir-276c MI0011634 - ref|NC_046681.1| 6348996 6349111 + -
dps-mir-2509 MI0011635 - ref|NC_046681.1| 6336958 6337057 + High
dps-mir-2510 MI0011636 - ref|NC_046681.1| 5946829 5946935 - High
dps-mir-2511-1 MI0011637 - ref|NC_046681.1| 5945630 5945746 - High
dps-mir-2511-2 MI0011638 - ref|NC_046681.1| 5940954 5941040 - High
dps-mir-2512 MI0011639 - ref|NC_046683.1| 36010345 36010441 + -
dps-mir-2513a MI0011640 - ref|NC_046683.1| 33702833 33702952 + -
dps-mir-2514 MI0011641 - ref|NC_046683.1| 23935709 23935788 + -
dps-mir-2515 MI0011642 - ref|NC_046683.1| 25422373 25422483 + Medium
dps-mir-2518-3 MI0011643 - ref|NW_022881705.1| 67775 67879 - Low
dps-mir-2518-2 MI0011644 - ref|NW_022881705.1| 67778 67871 - -
dps-mir-2518-4 MI0011645 - ref|NC_046683.1| 62921 63025 + Low
dps-mir-2513b MI0011646 - ref|NC_046683.1| 33702833 33702952 - -
dps-mir-2516 MI0011647 - ref|NW_022881698.1| 42495 42571 - -
dps-mir-2517-4 MI0011648 - None None High
dps-mir-2518-1 MI0011649 - ref|NW_022881705.1| 67778 67871 - Low
dps-mir-2574b MI0011650 - ref|NC_046683.1| 26685627 26685694 - -
dps-mir-2528-2 MI0011651 - ref|NC_046683.1| 35046755 35046872 - -
dps-mir-2519 MI0011652 - ref|NC_046683.1| 9732724 9732841 + High
dps-mir-2520 MI0011653 - ref|NC_046683.1| 9711102 9711221 + High
dps-mir-2521 MI0011654 - ref|NC_046683.1| 9710978 9711064 + -
dps-mir-2522a MI0011655 - ref|NC_046683.1| 9707838 9707949 + High
dps-mir-2523 MI0011656 - ref|NC_046683.1| 9706750 9706862 + High
dps-mir-2524 MI0011657 - ref|NC_046683.1| 9692735 9692827 + High
dps-mir-2525 MI0011658 - ref|NC_046683.1| 64600142 64600255 + -
dps-mir-2526 MI0011659 - ref|NC_046683.1| 3203970 3204075 - Low
dps-mir-2545b MI0011660 - ref|NC_046683.1| 16578294 16578411 + Medium
dps-mir-2527 MI0011661 - ref|NC_046683.1| 7982105 7982224 - High
dps-mir-2528-1 MI0011662 - ref|NC_046683.1| 31259156 31259273 - Low
dps-mir-2529 MI0011663 - ref|NC_046680.1| 14677058 14677170 + High
dps-mir-2530 MI0011664 - ref|NC_046683.1| 20237517 20237610 - Medium
dps-mir-2531 MI0011665 - ref|NC_046682.1| 327041 327155 + Medium
dps-mir-2532 MI0011666 - ref|NC_046683.1| 19161343 19161450 - Low
dps-mir-2533 MI0011667 - ref|NC_046680.1| 1766812 1766923 + Low
dps-mir-2534 MI0011668 - ref|NW_022881707.1| 140897 141013 + Medium
dps-mir-2535 MI0011669 - ref|NC_046683.1| 1639789 1639908 - Medium
dps-mir-2536 MI0011670 - ref|NC_046683.1| 9711368 9711478 + -
dps-mir-2537 MI0011671 - ref|NC_046683.1| 9711233 9711312 + High
dps-mir-2538 MI0011672 - ref|NC_046683.1| 9710478 9710593 + Medium
dps-mir-2522b MI0011673 - ref|NC_046683.1| 9710323 9710424 + -
dps-mir-2539 MI0011674 - ref|NC_046683.1| 9707065 9707171 + High
dps-mir-2540 MI0011675 - ref|NC_046683.1| 9706432 9706540 + High
dps-mir-2541 MI0011676 - ref|NC_046683.1| 9706086 9706193 + High
dps-mir-2542-1 MI0011677 - ref|NC_046683.1| 9691180 9691264 + High
dps-mir-2517-1 MI0011678 - ref|NC_046683.1| 9691691 9691795 + High
dps-mir-2543a-1 MI0011679 - ref|NC_046683.1| 9693541 9693656 + High
dps-mir-2542-2 MI0011680 - ref|NC_046683.1| 9698737 9698821 + High
dps-mir-2517-2 MI0011681 - ref|NC_046683.1| 9696094 9696198 + High
dps-mir-2543b-2 MI0011682 - ref|NC_046683.1| 9699830 9699945 + High
dps-mir-2542-3 MI0011683 - ref|NC_046683.1| 9691180 9691264 + High
dps-mir-2544 MI0011684 - ref|NC_046683.1| 9695220 9695324 + High
dps-mir-2543b-1 MI0011686 - ref|NC_046683.1| 9692276 9692391 + High
dps-mir-2545a MI0011687 - ref|NC_046683.1| 16578294 16578411 + High
dps-mir-2546 MI0011688 - ref|NC_046683.1| 12802353 12802436 - High
dps-mir-2547 MI0011689 - ref|NC_046683.1| 38287205 38287290 - High
dps-mir-2548 MI0011690 - ref|NC_046683.1| 38351221 38351318 - High
dps-mir-2549 MI0011691 - ref|NC_046683.1| 58142316 58142431 + High
dps-mir-2550 MI0011692 - ref|NC_046680.1| 22064503 22064614 - High
dps-mir-2551 MI0011693 - ref|NC_046680.1| 12414198 12414317 + High
dps-mir-2552 MI0011694 - ref|NC_046680.1| 12414979 12415089 + High
dps-mir-2553 MI0011695 - ref|NC_046680.1| 12415768 12415872 + Medium
dps-mir-2554 MI0011696 - ref|NC_046680.1| 12416074 12416190 + High
dps-mir-2507b MI0011697 - ref|NC_046680.1| 12416418 12416534 + High
dps-mir-2555 MI0011698 - ref|NC_046680.1| 20109233 20109294 + -
dps-mir-2556 MI0011699 - ref|NC_046680.1| 20697745 20697850 + High
dps-mir-2557 MI0011700 - ref|NC_046679.1| 839581 839672 + High
dps-mir-2558-1 MI0011701 - ref|NC_046681.1| 12142292 12142375 + High
dps-mir-2558-2 MI0011702 - ref|NC_046681.1| 12137927 12138020 + High
dps-mir-2559 MI0011703 - ref|NC_046681.1| 22815536 22815642 - -
dps-mir-2560 MI0011704 - ref|NC_046681.1| 21859730 21859846 + High
dps-mir-2561 MI0011705 - 4_group3 8461799 8461901 + High
dps-mir-2562 MI0011706 - ref|NC_046681.1| 8847258 8847321 + -
dps-mir-2563 MI0011707 - ref|NC_046681.1| 6336716 6336826 + High
dps-mir-2564 MI0011708 - ref|NC_046681.1| 7880251 7880359 - High
dps-mir-2565 MI0011709 - ref|NC_046681.1| 5967369 5967471 - High
dps-mir-2566a-1 MI0011710 - ref|NC_046681.1| 5945878 5945961 - High
dps-mir-2567a MI0011711 - ref|NC_046681.1| 5943738 5943822 - High
dps-mir-2566a-2 MI0011712 - ref|NC_046681.1| 5942069 5942154 - High
dps-mir-2567c MI0011713 - ref|NC_046681.1| 5941668 5941772 - High
dps-mir-2566b MI0011714 - ref|NC_046681.1| 5941196 5941278 - High
dps-mir-2567b MI0011715 - 4_group4 3554452 3554536 + High
dps-mir-2568a MI0011716 - ref|NC_046681.1| 16095981 16096068 - -
dps-mir-2569 MI0011717 - ref|NC_046681.1| 16134724 16134814 - High
dps-mir-2568b MI0011718 - ref|NC_046681.1| 16134864 16134983 - High
dps-mir-2570 MI0011719 - ref|NC_046683.1| 18996206 18996308 - Low
dps-mir-2571 MI0011720 - ref|NC_046679.1| 27518623 27518694 - High
dps-mir-2572 MI0011721 - ref|NC_046679.1| 1796669 1796758 - Medium
dps-mir-2573 MI0011722 - ref|NC_046683.1| 18682009 18682088 + -
dps-mir-2574a MI0011723 - ref|NC_046683.1| 26619922 26620034 + High
dps-mir-2543a-2 MI0011724 - ref|NC_046683.1| 9699091 9699206 + High
dps-mir-2517-3 MI0011725 - ref|NC_046683.1| 9693700 9693802 + High
dps-mir-2575 MI0011726 - ref|NC_046679.1| 15251161 15251280 + High
dps-mir-2576-1 MI0011727 - ref|NC_046683.1| 18638035 18638154 - Medium
dps-mir-2576-2 MI0011728 - ref|NW_022881705.1| 63988 64107 - Medium