Search results

Xenopus tropicalis miRNAs

Name Accession RPM Chromosome Start End Strand Confidence
xtr-let-7b MI0004787 - chr2 74186422 74186503 + -
xtr-mir-1a-2 MI0004788 - KV460667.1 104668 104738 - -
xtr-mir-1a-1 MI0004789 - chr6 93553281 93553364 - -
xtr-mir-7-1 MI0004790 - chr1 122025378 122025485 - -
xtr-mir-7-3 MI0004791 - chr8 111833876 111833963 + -
xtr-mir-7-2 MI0004792 - chr3 100078440 100078542 - -
xtr-mir-9a-1 MI0004793 - chr8 111349795 111349882 + -
xtr-mir-9a-2 MI0004794 - chr1 170225657 170225741 - -
xtr-mir-9b MI0004795 - chr1 102034631 102034704 + -
xtr-mir-10a MI0004796 - chr10 5060936 5061035 - -
xtr-mir-10b MI0004797 - chr9 59969699 59969786 + -
xtr-mir-10c MI0004798 - chr2 142821730 142821800 - -
xtr-mir-15a MI0004799 - chr2 146575525 146575607 - -
xtr-mir-15b MI0004800 - chr5 103362195 103362282 - -
xtr-mir-16c MI0004801 - chr8 47366673 47366742 - -
xtr-mir-16a MI0004802 - chr2 146575390 146575471 - -
xtr-mir-17 MI0004803 - chr2 120020382 120020468 - -
xtr-mir-19a MI0004804 - chr2 120020112 120020192 - -
xtr-mir-19b-2 MI0004805 - chr2 120019859 120019937 - -
xtr-mir-23a-2 MI0004806 - chr4 73605111 73605193 + -
xtr-mir-26-1 MI0004807 - chr2 138750893 138750977 - -
xtr-mir-26-2 MI0004808 - chr9 77064693 77064772 + -
xtr-mir-27a MI0004809 - chr3 129999278 129999353 + -
xtr-mir-27b MI0004810 - chr1 123463698 123463793 + -
xtr-mir-29d MI0004811 - chr3 75127544 75127618 - -
xtr-mir-29b MI0004812 - chr2 48073401 48073480 + -
xtr-mir-30a MI0004813 - chr5 91687780 91687850 - -
xtr-mir-30b MI0004814 - chr6 126125374 126125453 + -
xtr-mir-30c-1 MI0004815 - chr2 83742896 83742984 + -
xtr-mir-34a MI0004816 - chr7 80700727 80700822 - -
xtr-mir-34b-2 MI0004817 - chr7 75059637 75059703 - -
xtr-mir-34b-4 MI0004818 - None None -
xtr-mir-92a-2 MI0004819 - chr8 47197691 47197763 - -
xtr-mir-98 MI0004820 - chr8 8410552 8410659 - -
xtr-mir-99 MI0004821 - chr2 23121034 23121104 + -
xtr-mir-106 MI0004822 - chr8 47198219 47198281 - -
xtr-mir-107 MI0004823 - chr7 28096644 28096716 - -
xtr-mir-122 MI0004824 - chr1 188440156 188440224 - -
xtr-mir-125b-1 MI0004825 - chr7 88008751 88008838 + -
xtr-mir-125b-2 MI0004826 - chr2 23205565 23205649 + -
xtr-mir-126 MI0004827 - KV460453.1 92197 92265 + -
xtr-mir-128-2 MI0004828 - chr6 82768836 82768915 + -
xtr-mir-129-1 MI0004829 - chr4 3080976 3081065 + -
xtr-mir-129-2 MI0004830 - chr3 78292717 78292798 - -
xtr-mir-130a MI0004831 - chr2 91417440 91417522 + -
xtr-mir-130c MI0004832 - chr1 145403553 145403623 - -
xtr-mir-130b MI0004833 - chr1 145394707 145394782 - -
xtr-mir-132 MI0004834 - chr2 27663361 27663447 + -
xtr-mir-133c MI0004835 - KV460667.1 81387 81472 - -
xtr-mir-133d MI0004836 - chr2 56468426 56468501 - -
xtr-mir-133b MI0004837 - KV460357.1 1078318 1078392 - -
xtr-mir-135-1 MI0004838 - chr3 41571695 41571794 + -
xtr-mir-138 MI0004839 - chr6 73571438 73571522 + -
xtr-mir-139 MI0004840 - chr2 170077879 170077945 - -
xtr-mir-140 MI0004841 - chr4 62459936 62460029 + -
xtr-mir-142-1 MI0004842 - chr2 38445580 38445665 + -
xtr-mir-142-2 MI0004843 - chr2 38446762 38446847 + -
xtr-mir-146a MI0004844 - chr3 14163615 14163704 + -
xtr-mir-148b MI0004845 - chr2 142379057 142379153 - -
xtr-mir-150 MI0004846 - chr7 102581280 102581343 - -
xtr-mir-153-1 MI0004847 - chr9 78533740 78533826 + -
xtr-mir-155 MI0004848 - chr2 14606418 14606486 - -
xtr-mir-181b-1 MI0004849 - chr4 101423391 101423473 - -
xtr-mir-181b-2 MI0004850 - KV460364.1 1381322 1381404 + -
xtr-mir-182 MI0004851 - chr3 77404446 77404550 + -
xtr-mir-183 MI0004852 - chr3 77399646 77399742 + -
xtr-mir-184 MI0004853 - chr3 115714268 115714350 - -
xtr-mir-187 MI0004854 - chr6 35813953 35814034 - -
xtr-mir-192 MI0004855 - chr4 38493641 38493727 + -
xtr-mir-193 MI0004856 - chr9 32322992 32323074 - -
xtr-mir-194-1 MI0004857 - chr5 6915454 6915533 + -
xtr-mir-194-2 MI0004858 - chr4 38492064 38492149 + -
xtr-mir-199a MI0004859 - chr4 97341496 97341591 + -
xtr-mir-202-1 MI0004860 - chr7 18586257 18586343 + -
xtr-mir-202-2 MI0004861 - chr7 18578547 18578633 + -
xtr-mir-205b MI0004862 - chr4 125249612 125249683 - -
xtr-mir-206 MI0004863 - KV460357.1 1079506 1079575 - -
xtr-mir-210 MI0004864 - chr4 39569264 39569354 - -
xtr-mir-181a-1 MI0004865 - chr4 101423843 101423932 - -
xtr-mir-181a-2 MI0004866 - KV460364.1 1377155 1377249 + -
xtr-mir-214 MI0004867 - chr4 97346601 97346707 + -
xtr-mir-215 MI0004868 - chr5 6916154 6916250 + -
xtr-mir-216 MI0004869 - chr5 26049025 26049115 - -
xtr-mir-217 MI0004870 - chr5 26048662 26048744 - -
xtr-mir-218-1 MI0004871 - chr1 22730596 22730704 - -
xtr-mir-218-2 MI0004872 - chr3 24052813 24052896 + -
xtr-mir-219 MI0004873 - chr8 7839280 7839374 + -
xtr-mir-222 MI0004874 - chr2 68930297 68930360 + -
xtr-mir-223 MI0004875 - chr8 19321710 19321795 - -
xtr-mir-301-1 MI0004876 - chr2 91417649 91417732 + -
xtr-mir-301-2 MI0004877 - chr1 145402708 145402780 - -
xtr-mir-302 MI0004878 - chr1 59518998 59519066 - -
xtr-mir-365-1 MI0004879 - chr9 32274421 32274506 - -
xtr-mir-367 MI0004880 - chr1 59518699 59518761 - -
xtr-mir-383 MI0004881 - chr1 32341375 32341447 - -
xtr-mir-425 MI0004882 - chr4 126189455 126189531 - -
xtr-mir-455 MI0004883 - chr8 2703728 2703814 + -
xtr-mir-489 MI0004884 - chr6 24122612 24122695 - -
xtr-mir-499 MI0004885 - chr10 34537722 34537808 - -
xtr-let-7c MI0004886 - chr2 23121720 23121813 + -
xtr-let-7f MI0004887 - chr8 8410819 8410901 - -
xtr-let-7g MI0004888 - chr4 117752088 117752171 + -
xtr-let-7i MI0004889 - chr3 42598461 42598545 - -
xtr-mir-1b MI0004890 - chr2 56468865 56468926 - -
xtr-mir-9-3 MI0004891 - chr3 99283850 99283925 + -
xtr-mir-15c MI0004892 - chr8 47368665 47368738 - -
xtr-mir-18a MI0004893 - chr2 120020254 120020340 - -
xtr-mir-23a-1 MI0004894 - chr3 129998670 129998747 + -
xtr-mir-24a MI0004895 - chr1 123464315 123464381 + -
xtr-mir-24b MI0004896 - chr3 129999414 129999481 + -
xtr-mir-29a MI0004897 - chr3 75124877 75124963 - -
xtr-mir-30d MI0004898 - chr6 126121129 126121209 + -
xtr-mir-92b MI0004899 - None None -
xtr-mir-93a MI0004900 - KV460378.1 107132 107204 - -
xtr-mir-93b MI0004901 - None None -
xtr-mir-96 MI0004902 - chr3 77400813 77400887 + -
xtr-mir-101a-2 MI0004903 - chr4 79102552 79102634 - -
xtr-mir-103-1 MI0004904 - chr3 24141492 24141576 + -
xtr-mir-148a MI0004905 - chr6 33524404 33524489 + -
xtr-mir-338-1 MI0004906 - chr10 18675785 18675862 + -
xtr-let-7e-1 MI0004907 - None None -
xtr-let-7a MI0004908 - chr7 112714565 112714653 + -
xtr-let-7e-2 MI0004909 - None None -
xtr-mir-16b MI0004910 - chr5 103362038 103362121 - -
xtr-mir-20a MI0004911 - chr2 120019984 120020067 - -
xtr-mir-22 MI0004912 - chr2 40225968 40226059 + -
xtr-mir-23b MI0004913 - chr1 123463474 123463561 + -
xtr-mir-25-1 MI0004914 - KV460378.1 106999 107080 - -
xtr-mir-25-2 MI0004915 - None None -
xtr-mir-27c-1 MI0004916 - chr4 73605400 73605481 + -
xtr-mir-27c-2 MI0004917 - None None -
xtr-mir-29c MI0004918 - chr2 48076534 48076623 + -
xtr-mir-30c-2 MI0004919 - chr5 91680390 91680467 - -
xtr-mir-30e MI0004920 - chr2 83741892 83741981 + -
xtr-mir-31a MI0004921 - chr1 108909677 108909764 - -
xtr-mir-33a MI0004922 - chr9 9608383 9608450 + -
xtr-mir-33b MI0004923 - chr4 109768746 109768814 + -
xtr-mir-34b-3 MI0004924 - None None -
xtr-mir-34b-1 MI0004925 - chr7 75066349 75066433 + -
xtr-mir-92a-1 MI0004926 - chr2 120019740 120019817 - -
xtr-mir-100 MI0004927 - chr7 112711713 112711788 + -
xtr-mir-101a-1 MI0004928 - chr1 115031336 115031426 - -
xtr-mir-103-2 MI0004929 - chr1 6083393 6083475 + -
xtr-mir-124 MI0004930 - chr6 103250597 103250684 + -
xtr-mir-125a MI0004931 - chr7 112726415 112726476 + -
xtr-mir-128-1 MI0004932 - chr9 78757409 78757491 - -
xtr-mir-135-2 MI0004933 - chr2 64757290 64757377 - -
xtr-mir-137-1 MI0004934 - chr4 92672706 92672806 - -
xtr-mir-137-2 MI0004935 - None None -
xtr-mir-137-3 MI0004936 - None None -
xtr-mir-143 MI0004937 - chr3 31806258 31806340 + -
xtr-mir-144 MI0004938 - chr2 26506542 26506603 + -
xtr-mir-145 MI0004939 - chr3 31807219 31807304 + -
xtr-mir-153-2 MI0004940 - chr6 10079147 10079232 - -
xtr-mir-191 MI0004941 - chr4 126192661 126192746 - -
xtr-mir-196a MI0004942 - chr2 142905363 142905468 - -
xtr-mir-196b MI0004943 - chr6 32896531 32896617 + -
xtr-mir-199b MI0004944 - chr3 127964099 127964208 - -
xtr-mir-200a MI0004945 - chr7 78800601 78800689 - -
xtr-mir-200b MI0004946 - chr7 78802277 78802365 - -
xtr-mir-203 MI0004947 - chr8 77988319 77988392 + -
xtr-mir-204-2 MI0004948 - chr1 117768506 117768593 - -
xtr-mir-204-1 MI0004949 - chr3 87225643 87225747 + -
xtr-mir-205a MI0004950 - chr2 46983780 46983865 - -
xtr-mir-208 MI0004951 - chr1 127564536 127564616 - -
xtr-mir-212 MI0004952 - chr2 27657630 27657725 + -
xtr-mir-221 MI0004953 - chr2 68930805 68930897 + -
xtr-mir-338-2 MI0004954 - chr9 20077939 20077998 + -
xtr-mir-363 MI0004955 - chr8 47197557 47197643 - -
xtr-mir-429 MI0004956 - chr7 78797776 78797862 - -
xtr-mir-449a MI0004957 - chr1 178899869 178899955 + -
xtr-mir-451 MI0004958 - chr2 26507250 26507311 + -
xtr-mir-18b MI0004959 - chr8 47198092 47198169 - -
xtr-mir-19b-1 MI0004960 - chr8 47197821 47197893 - -
xtr-mir-20b MI0004961 - chr8 47197934 47198007 - -
xtr-mir-133a MI0004962 - chr6 93550858 93550943 - -
xtr-mir-428a MI0004963 - KV460579.1 115424 115494 - -
xtr-mir-31b MI0006264 - chr8 109552679 109552754 + -
xtr-mir-146b MI0006265 - chr1 8024073 8024172 + -
xtr-mir-320 MI0006266 - chr7 80077496 80077615 + -
xtr-mir-375 MI0006267 - chr9 77564211 77564280 - -
xtr-mir-427-1 MI0006268 - chr3 133221387 133221456 - -
xtr-mir-427-2 MI0006269 - chr3 133222427 133222496 - -
xtr-mir-427-3 MI0006270 - chr3 133222853 133222922 - -
xtr-mir-2184 MI0011553 - chr2 27689426 27689507 - -
xtr-mir-2188 MI0011554 - chr3 120050642 120050723 - -
xtr-mir-449b MI0018161 - chr1 178899727 178899812 + -
xtr-mir-449c MI0018162 - chr1 178899485 178899577 + -
xtr-mir-190 MI0022169 - None None -
xtr-mir-9406 MI0028999 - chr3 11253226 11253320 + -
xtr-mir-9407 MI0029000 - chr7 25022371 25022465 - -
xtr-mir-428b MI0029001 - KV460579.1 115024 115118 - -
xtr-mir-454 MI0029367 - chr1 145396839 145396941 - -
xtr-mir-460a MI0029368 - chr6 3768586 3768668 - -
xtr-mir-460b MI0029369 - chr8 44862150 44862232 + -
xtr-mir-551b MI0029370 - chr5 101175007 101175086 - -
Comments or questions? Email mirbase@manchester.ac.uk